ZOOM Lite

Cur síos

Bogearraí mapála agus léirshamhlaithe sonraí den chéad ghlúin eile é ZOOM Lite. Déanann úsáideoirí géanóm tagartha a ionchur agus léann gearrscannáin Illumina/Solexa comhaid nó léann spás datha AB SOLiD comhaid i bhformáidí éagsúla, mar shampla * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta srl. Aschuir ZOOM torthaí mapála na ngearr seo léann ar an seicheamh tagartha. Tá eithne mapála tapa agus cruinn ag ZOOM Lite atá bunaithe ar theoiric síl spásáilte il-dheartha nua-dheartha. Is féidir léamh aon chríoch agus péireáilte de fhaid éagsúla ó 15bp go 240bp a láimhseáil. Ceadaítear aon líon mímheaitseálacha agus aon chur isteach/scriosadh faid éagsúla idir an léamh agus a sprioc-réigiún ar an seicheamh tagartha. Tabharfar tuairisc ar thorthaí uathúla mapáilte nó ar na torthaí is fearr (barr N) do gach léamh de réir na mímheaitseálacha íosta agus an fad indel. Úsáidtear scóir cháilíochta chun cruinneas mapála a fheabhsú. Bunaithe ar an eithne mapála, tugann ZOOM Lite deis d’úsáideoirí sonraí léitheoireachta áitiúla agus sonraí seicheamh tagartha a luchtú, paraiméadair cheart a roghnú, sonraí ardtoirte a phróiseáil go comhthreomhar i measc suas le ceithre LAP, monatóireacht a dhéanamh ar na tascanna reatha, na torthaí mapála a stóráil, féachaint ar ghraif na torthaí mapála agus torthaí mapála aschuir i bhformáidí comhaid * .BED nó * .GFF le haghaidh tuilleadh suirbhéireachta le faisnéis rian brabhsálaí UCSC. Is féidir torthaí mapála a fheiceáil ar aon scála atá ag teastáil, ón ngraf doimhneachta léite thar chrómasóim iomlán go ailínithe seicheamh mionsonraithe idir léamha agus an t-ord tagartha. Is furasta le húsáideoirí nascleanúint a dhéanamh chuig réigiúin spéisiúla trí chliceáil agus tarraing nó scrollaigh. Is díorthach de bhogearraí ZOOM Studio é ZOOM Lite.