POY 4.1.2

POY: Na Bogearraí Anailíse Phylogenetic Deiridh

Má tá tú ag lorg clár anailíse phylogenetic cumhachtach agus ilúsáideach, ná bí ag súil le POY. Tá na bogearraí oideachais seo deartha chun tacú le cineálacha iolracha sonraí, lena n-áirítear moirfeolaíocht, núicléatídí, géinte agus réigiúin ghéinte, crómasóim, agus géanóim iomlána. Le POY, is féidir leat fíor-ailíniú agus tátal phylogeny a dhéanamh gan gá le seichimh ionchuir réamh-ailínithe.

Ceann de na rudaí a leagann POY amach ó chláir anailíse fylogenetic eile ná a chumas ionsá, scriosadh, agus athshocruithe a áireamh sa scór iomlán crann faoi Uasmhéid Parsimony nó sa mhúnla faoi Chosúlacht Uasta. Is uirlis iontach é seo do thaighdeoirí ar spéis leo staidéar a dhéanamh ar chaidrimh éabhlóideacha thar raon leathan orgánach.

Tairgeann POY éagsúlacht halgartaim heorastúla freisin a forbraíodh go sonrach chun na críche seo. Cuirtear na halgartaim seo i bhfeidhm laistigh de na bogearraí féin chun a chinntiú go bhfuil do chuid anailísí chomh cruinn agus chomh héifeachtach agus is féidir.

Cibé an bhfuil tú ag obair le tacair shonraí beaga nó le tacair sonraí géanómaíochta ar mhórscála, tá gach rud atá uait ag POY chun tús a chur le do thaighde. Seo breathnú níos géire ar chuid dá phríomhghnéithe:

Ailíniú Fíor

Le fíorchumais ailínithe POY, ní gá seichimh ionchuir a réamhailíniú roimh do chuid anailísí a rith. Sábhálann sé seo am agus cinntíonn sé go bhfuil do thorthaí chomh cruinn agus is féidir.

Tátail Phylogeny

Ligeann POY duit phylogenies a tátal ag baint úsáide as modhanna Uasta Parsimony (MP) agus Uasdóchúlacht (ML). Is féidir leat an modh is fearr a oireann do do riachtanais a roghnú bunaithe ar an gcineál sonraí a bhfuil tú ag obair leo.

Ionsáigh/Scriosanna/Athshocruithe

Áiríonn POY ionsá/scriosadh/athshocruithe i scóir chrainn MP agus samhlacha ML araon de réir réamhshocraithe. Ciallaíonn sé seo gur féidir fiú imeachtaí éabhlóideacha casta a léiriú go cruinn i do chuid anailísí.

Algartam Heuristic

Forbraíodh éagsúlacht halgartaim heorastúla go sonrach le húsáid le POY. Cuidíonn na halgartaim seo lena chinntiú go rithfidh d’anailísí go tapa agus iad fós ag tabhairt torthaí cruinne.

Cineálacha Sonraí Il Tacaithe

Cibé an bhfuil tú ag obair le sonraí moirfeolaíochta nó le seichimh iomlána genome, tacaíonn POY le cineálacha iomadúla sonraí ionas gur féidir leat anailís a dhéanamh ar aon orgánach beag beann ar a chastacht.

Comhéadan Éasca le Úsáid

In ainneoin a chumais chun cinn, tá POY éasca le húsáid a bhuíochas dá dhearadh comhéadan iomasach. Ní gá duit aon taithí ríomhchlárú nó saineolas speisialaithe chun tús a chur leis an uirlis chumhachtach bogearraí!

I gcrích,

Má tá tú ag lorg clár bogearraí oideachais atá deartha go sonrach chun críocha anailíse fíogéiniteach, ná bí ag súil le POY! Leis na gnéithe casta cosúil le cumais ailíniú fíor; tacaíocht d’ilchineálacha sonraí lena n-áirítear faisnéis mhoirfeolaíochta seicheamh DNA; cuimsiú/scriosadh/athshocrú i scóir chrainn MP & samhlacha ML de réir réamhshocraithe; halgartaim heorastúla éagsúla a forbraíodh go díreach ionas go n-oibríonn siad gan uaim laistigh den fheidhmchlár seo - iad go léir fillte suas go néata i gcomhéadan amháin atá éasca le húsáid - níl aon rud eile ann i ndáiríre cosúil leis!